Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif3aP28741 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kif3aP28741 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kif3aP28741 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kif3aP28741 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kif3aP28741 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kif3aP28741 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms