Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RxrgP28705 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RxrgP28705 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RxrgP28705 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RxrgP28705 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RxrgP28705 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RxrgP28705 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RxrgP28705 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RxrgP28705 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RxrgP28705 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxrgP28705 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxrgP28705 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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