Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Marcksl1P28667 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Marcksl1P28667 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Marcksl1P28667 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Marcksl1P28667 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Marcksl1P28667 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Marcksl1P28667 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Marcksl1P28667 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Marcksl1P28667 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Marcksl1P28667 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms