Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1bP28334 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Htr1bP28334 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Htr1bP28334 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htr1bP28334 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htr1bP28334 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms