Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa4P28311 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa4P28311 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa4P28311 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa4P28311 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa4P28311 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa4P28311 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms