Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vav1P27870 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vav1P27870 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vav1P27870 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vav1P27870 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vav1P27870 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vav1P27870 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vav1P27870 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vav1P27870 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vav1P27870 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vav1P27870 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vav1P27870 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav1P27870 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav1P27870 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vav1P27870 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav1P27870 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav1P27870 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav1P27870 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav1P27870 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav1P27870 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms