Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afxP27661 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2afxP27661 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afxP27661 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afxP27661 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afxP27661 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2afxP27661 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afxP27661 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afxP27661 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2afxP27661 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afxP27661 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms