Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af2P26369 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af2P26369 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2af2P26369 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af2P26369 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af2P26369 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af2P26369 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2af2P26369 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
U2af2P26369 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2af2P26369 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af2P26369 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af2P26369 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af2P26369 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af2P26369 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af2P26369 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af2P26369 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af2P26369 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af2P26369 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af2P26369 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af2P26369 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af2P26369 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
U2af2P26369 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af2P26369 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af2P26369 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af2P26369 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af2P26369 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af2P26369 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms