Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZfaP23607 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZfaP23607 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZfaP23607 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZfaP23607 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfaP23607 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZfaP23607 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZfaP23607 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZfaP23607 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfaP23607 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZfaP23607 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZfaP23607 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZfaP23607 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfaP23607 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZfaP23607 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZfaP23607 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfaP23607 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms