Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RarbP22605 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RarbP22605 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RarbP22605 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RarbP22605 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RarbP22605 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RarbP22605 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RarbP22605 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RarbP22605 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RarbP22605 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RarbP22605 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RarbP22605 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RarbP22605 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RarbP22605 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RarbP22605 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RarbP22605 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RarbP22605 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RarbP22605 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RarbP22605 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RarbP22605 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RarbP22605 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RarbP22605 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RarbP22605 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RarbP22605 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RarbP22605 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RarbP22605 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RarbP22605 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RarbP22605 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RarbP22605 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RarbP22605 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RarbP22605 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RarbP22605 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RarbP22605 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RarbP22605 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RarbP22605 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RarbP22605 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RarbP22605 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RarbP22605 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RarbP22605 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RarbP22605 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RarbP22605 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RarbP22605 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RarbP22605 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RarbP22605 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RarbP22605 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RarbP22605 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RarbP22605 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RarbP22605 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RarbP22605 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RarbP22605 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RarbP22605 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RarbP22605 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RarbP22605 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RarbP22605 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RarbP22605 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RarbP22605 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RarbP22605 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RarbP22605 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RarbP22605 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RarbP22605 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RarbP22605 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RarbP22605 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RarbP22605 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RarbP22605 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RarbP22605 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RarbP22605 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RarbP22605 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RarbP22605 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RarbP22605 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RarbP22605 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RarbP22605 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RarbP22605 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RarbP22605 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RarbP22605 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RarbP22605 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RarbP22605 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RarbP22605 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RarbP22605 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RarbP22605 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RarbP22605 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RarbP22605 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RarbP22605 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms