Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk1P22518 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk1P22518 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk1P22518 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk1P22518 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk1P22518 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clk1P22518 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk1P22518 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk1P22518 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk1P22518 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk1P22518 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk1P22518 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk1P22518 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk1P22518 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk1P22518 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk1P22518 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk1P22518 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk1P22518 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk1P22518 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms