Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SagP20443 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SagP20443 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SagP20443 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SagP20443 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SagP20443 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SagP20443 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SagP20443 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SagP20443 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SagP20443 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SagP20443 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SagP20443 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SagP20443 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SagP20443 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SagP20443 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SagP20443 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SagP20443 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SagP20443 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SagP20443 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SagP20443 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SagP20443 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SagP20443 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SagP20443 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SagP20443 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SagP20443 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SagP20443 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SagP20443 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SagP20443 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SagP20443 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SagP20443 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SagP20443 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SagP20443 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SagP20443 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SagP20443 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SagP20443 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SagP20443 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SagP20443 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SagP20443 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SagP20443 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SagP20443 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SagP20443 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SagP20443 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SagP20443 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SagP20443 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SagP20443 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SagP20443 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SagP20443 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SagP20443 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SagP20443 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SagP20443 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SagP20443 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SagP20443 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SagP20443 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SagP20443 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SagP20443 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SagP20443 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SagP20443 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SagP20443 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SagP20443 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SagP20443 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SagP20443 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SagP20443 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SagP20443 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SagP20443 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SagP20443 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SagP20443 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SagP20443 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SagP20443 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SagP20443 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SagP20443 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SagP20443 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SagP20443 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SagP20443 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SagP20443 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SagP20443 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SagP20443 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SagP20443 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SagP20443 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SagP20443 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SagP20443 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SagP20443 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SagP20443 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SagP20443 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SagP20443 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SagP20443 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SagP20443 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SagP20443 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SagP20443 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SagP20443 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SagP20443 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SagP20443 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SagP20443 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SagP20443 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SagP20443 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms