Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfeP19426 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfeP19426 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfeP19426 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfeP19426 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfeP19426 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfeP19426 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfeP19426 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NelfeP19426 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NelfeP19426 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NelfeP19426 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfeP19426 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfeP19426 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfeP19426 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfeP19426 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfeP19426 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NelfeP19426 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NelfeP19426 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NelfeP19426 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NelfeP19426 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms