Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RargP18911 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RargP18911 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RargP18911 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RargP18911 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RargP18911 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RargP18911 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RargP18911 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RargP18911 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RargP18911 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RargP18911 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RargP18911 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RargP18911 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RargP18911 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RargP18911 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RargP18911 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RargP18911 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RargP18911 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RargP18911 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RargP18911 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RargP18911 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RargP18911 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RargP18911 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RargP18911 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RargP18911 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RargP18911 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RargP18911 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RargP18911 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RargP18911 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RargP18911 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RargP18911 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RargP18911 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RargP18911 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RargP18911 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RargP18911 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RargP18911 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RargP18911 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RargP18911 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RargP18911 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RargP18911 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RargP18911 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RargP18911 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RargP18911 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RargP18911 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RargP18911 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RargP18911 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RargP18911 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RargP18911 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RargP18911 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RargP18911 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RargP18911 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RargP18911 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RargP18911 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RargP18911 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RargP18911 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RargP18911 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RargP18911 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RargP18911 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RargP18911 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RargP18911 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RargP18911 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RargP18911 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RargP18911 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RargP18911 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RargP18911 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RargP18911 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RargP18911 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RargP18911 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RargP18911 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RargP18911 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RargP18911 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RargP18911 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RargP18911 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RargP18911 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RargP18911 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RargP18911 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RargP18911 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RargP18911 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RargP18911 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RargP18911 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RargP18911 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RargP18911 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RargP18911 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RargP18911 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RargP18911 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RargP18911 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RargP18911 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RargP18911 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RargP18911 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RargP18911 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RargP18911 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RargP18911 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms