Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps6ka1P18653 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka1P18653 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka1P18653 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka1P18653 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rps6ka1P18653 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6ka1P18653 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms