Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spi1P17433 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spi1P17433 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spi1P17433 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spi1P17433 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spi1P17433 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Spi1P17433 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spi1P17433 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms