Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh2P15116 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh2P15116 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh2P15116 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh2P15116 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh2P15116 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms