Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54P14576 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp54P14576 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp54P14576 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp54P14576 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54P14576 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54P14576 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srp54P14576 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp54P14576 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp54P14576 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srp54P14576 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srp54P14576 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srp54P14576 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srp54P14576 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srp54P14576 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srp54P14576 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp54P14576 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srp54P14576 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms