Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tnni2P13412 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tnni2P13412 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tnni2P13412 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tnni2P13412 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Tnni2P13412 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tnni2P13412 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tnni2P13412 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Tnni2P13412 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tnni2P13412 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tnni2P13412 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tnni2P13412 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms