Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1P13405 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1P13405 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1P13405 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1P13405 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1P13405 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1P13405 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1P13405 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rb1P13405 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1P13405 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1P13405 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1P13405 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1P13405 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1P13405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rb1P13405 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms