Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd5P13379 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd5P13379 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd5P13379 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd5P13379 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd5P13379 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd5P13379 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd5P13379 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd5P13379 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd5P13379 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd5P13379 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd5P13379 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd5P13379 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd5P13379 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms