Protein–RNA interactions for Protein: P11798

Camk2a, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2aP11798 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camk2aP11798 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Camk2aP11798 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Camk2aP11798 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Camk2aP11798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Camk2aP11798 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms