Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc6P10629 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc6P10629 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc6P10629 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc6P10629 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc6P10629 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc6P10629 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc6P10629 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6P10629 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms