Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Schip1P0DPB4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Schip1P0DPB4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Schip1P0DPB4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Schip1P0DPB4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Schip1P0DPB4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Schip1P0DPB4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Schip1P0DPB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms