Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3cP0DOY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnmt3cP0DOY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt3cP0DOY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3cP0DOY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3cP0DOY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196 ms