Protein–RNA interactions for Protein: P0DOV2

Ifi204, Interferon-activable protein 204, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi204P0DOV2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi204P0DOV2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi204P0DOV2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi204P0DOV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi204P0DOV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi204P0DOV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi204P0DOV2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi204P0DOV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi204P0DOV2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi204P0DOV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi204P0DOV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms