Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa9P09631 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa9P09631 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa9P09631 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa9P09631 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa9P09631 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms