Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf1P07141 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms