Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoa4P06728 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa4P06728 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa4P06728 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa4P06728 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa4P06728 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms