Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JunP05627 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
JunP05627 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
JunP05627 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
JunP05627 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JunP05627 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JunP05627 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JunP05627 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JunP05627 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JunP05627 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JunP05627 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JunP05627 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JunP05627 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JunP05627 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JunP05627 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JunP05627 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JunP05627 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JunP05627 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JunP05627 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
JunP05627 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JunP05627 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JunP05627 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JunP05627 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JunP05627 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JunP05627 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JunP05627 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JunP05627 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JunP05627 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JunP05627 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JunP05627 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
JunP05627 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JunP05627 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JunP05627 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JunP05627 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JunP05627 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JunP05627 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JunP05627 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
JunP05627 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
JunP05627 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JunP05627 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JunP05627 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JunP05627 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JunP05627 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JunP05627 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JunP05627 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JunP05627 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JunP05627 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JunP05627 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JunP05627 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JunP05627 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JunP05627 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JunP05627 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
JunP05627 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
JunP05627 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JunP05627 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
JunP05627 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JunP05627 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
JunP05627 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JunP05627 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JunP05627 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
JunP05627 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JunP05627 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JunP05627 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JunP05627 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JunP05627 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JunP05627 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JunP05627 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JunP05627 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JunP05627 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JunP05627 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JunP05627 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JunP05627 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JunP05627 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms