Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba3aP05214 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba3aP05214 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba3aP05214 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tuba3aP05214 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba3aP05214 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms