Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrygdP04342 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrygdP04342 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrygdP04342 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrygdP04342 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrygdP04342 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrygdP04342 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrygdP04342 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrygdP04342 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrygdP04342 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrygdP04342 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CrygdP04342 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrygdP04342 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrygdP04342 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrygdP04342 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrygdP04342 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrygdP04342 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrygdP04342 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrygdP04342 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrygdP04342 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms