Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01819 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01819 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01819 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01819 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01819 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01819 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01819 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01819 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01819 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01819 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01819 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01819 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01819 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01819 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01819 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01819 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01819 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01819 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01819 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01819 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01819 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01819 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01819 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01819 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01819 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01819 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01819 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01819 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01819 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01819 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01819 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01819 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01819 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01819 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01819 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01819 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01819 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01819 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01819 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01819 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01819 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01819 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01819 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01819 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01819 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01819 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01819 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01819 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms