Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01807 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
P01807 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01807 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01807 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01807 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01807 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01807 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01807 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01807 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01807 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01807 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01807 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01807 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01807 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01807 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01807 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01807 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01807 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01807 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01807 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01807 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01807 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01807 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01807 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01807 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01807 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01807 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01807 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01807 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01807 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01807 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01807 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01807 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01807 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01807 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01807 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01807 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01807 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01807 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01807 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01807 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01807 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01807 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01807 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01807 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01807 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01807 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01807 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01807 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01807 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01807 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01807 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01807 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01807 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01807 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01807 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01807 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01807 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01807 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01807 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01807 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01807 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01807 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01807 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01807 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01807 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01807 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01807 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01807 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01807 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01807 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01807 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01807 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01807 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01807 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01807 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01807 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01807 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01807 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01807 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
P01807 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01807 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01807 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01807 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P01807 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01807 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01807 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01807 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01807 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01807 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01807 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01807 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01807 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01807 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01807 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01807 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01807 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01807 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01807 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms