Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01792 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01792 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01792 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01792 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01792 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01792 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01792 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01792 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01792 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01792 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01792 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01792 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01792 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01792 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01792 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01792 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01792 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01792 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01792 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01792 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01792 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01792 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01792 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01792 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01792 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01792 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01792 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01792 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01792 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01792 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01792 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01792 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01792 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01792 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01792 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01792 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01792 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01792 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01792 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01792 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01792 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01792 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01792 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01792 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01792 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01792 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01792 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01792 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01792 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01792 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01792 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01792 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01792 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01792 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01792 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01792 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01792 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01792 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01792 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01792 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01792 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01792 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01792 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01792 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms