Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01647 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01647 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01647 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
P01647 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01647 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01647 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01647 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01647 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P01647 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P01647 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P01647 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P01647 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01647 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01647 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01647 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01647 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01647 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01647 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P01647 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P01647 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
P01647 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
P01647 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P01647 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
P01647 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01647 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01647 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01647 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01647 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01647 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01647 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01647 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01647 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01647 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01647 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P01647 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P01647 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P01647 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01647 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01647 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01647 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01647 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01647 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P01647 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P01647 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P01647 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01647 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01647 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01647 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01647 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01647 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01647 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01647 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01647 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01647 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01647 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01647 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01647 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01647 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01647 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01647 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01647 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01647 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P01647 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01647 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01647 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P01647 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01647 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01647 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01647 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P01647 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01647 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01647 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01647 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01647 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01647 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P01647 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01647 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01647 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01647 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01647 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01647 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01647 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
P01647 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01647 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01647 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01647 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01647 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01647 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01647 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01647 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01647 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01647 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
P01647 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms