Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp8O89110 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp8O89110 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp8O89110 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp8O89110 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp8O89110 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp8O89110 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp8O89110 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp8O89110 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp8O89110 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp8O89110 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp8O89110 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp8O89110 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms