Protein–RNA interactions for Protein: O89029

Matn4, Matrilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn4O89029 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn4O89029 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matn4O89029 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matn4O89029 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn4O89029 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn4O89029 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn4O89029 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn4O89029 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn4O89029 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn4O89029 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn4O89029 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn4O89029 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Matn4O89029 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn4O89029 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn4O89029 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn4O89029 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn4O89029 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn4O89029 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn4O89029 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Matn4O89029 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Matn4O89029 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn4O89029 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn4O89029 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matn4O89029 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms