Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MscO88940 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MscO88940 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MscO88940 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MscO88940 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MscO88940 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MscO88940 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MscO88940 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MscO88940 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MscO88940 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MscO88940 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MscO88940 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MscO88940 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MscO88940 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MscO88940 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MscO88940 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MscO88940 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MscO88940 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MscO88940 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MscO88940 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MscO88940 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MscO88940 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MscO88940 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MscO88940 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MscO88940 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MscO88940 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MscO88940 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MscO88940 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MscO88940 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MscO88940 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MscO88940 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MscO88940 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MscO88940 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MscO88940 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MscO88940 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MscO88940 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MscO88940 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MscO88940 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MscO88940 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MscO88940 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MscO88940 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MscO88940 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MscO88940 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MscO88940 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MscO88940 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MscO88940 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MscO88940 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MscO88940 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MscO88940 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MscO88940 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MscO88940 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MscO88940 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MscO88940 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MscO88940 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MscO88940 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MscO88940 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MscO88940 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MscO88940 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MscO88940 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MscO88940 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MscO88940 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MscO88940 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MscO88940 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MscO88940 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MscO88940 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MscO88940 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MscO88940 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MscO88940 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MscO88940 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MscO88940 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MscO88940 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MscO88940 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MscO88940 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MscO88940 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MscO88940 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MscO88940 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MscO88940 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MscO88940 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MscO88940 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MscO88940 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MscO88940 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MscO88940 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MscO88940 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MscO88940 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MscO88940 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MscO88940 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MscO88940 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MscO88940 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MscO88940 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MscO88940 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MscO88940 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MscO88940 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MscO88940 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MscO88940 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MscO88940 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MscO88940 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MscO88940 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MscO88940 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MscO88940 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MscO88940 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms