Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShdO88834 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ShdO88834 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ShdO88834 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShdO88834 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShdO88834 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShdO88834 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ShdO88834 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShdO88834 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ShdO88834 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShdO88834 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShdO88834 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShdO88834 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ShdO88834 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ShdO88834 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShdO88834 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShdO88834 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShdO88834 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShdO88834 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShdO88834 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShdO88834 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShdO88834 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShdO88834 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShdO88834 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShdO88834 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShdO88834 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShdO88834 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShdO88834 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShdO88834 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShdO88834 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShdO88834 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ShdO88834 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ShdO88834 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ShdO88834 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ShdO88834 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ShdO88834 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ShdO88834 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ShdO88834 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ShdO88834 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ShdO88834 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ShdO88834 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ShdO88834 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ShdO88834 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ShdO88834 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ShdO88834 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ShdO88834 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ShdO88834 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ShdO88834 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShdO88834 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShdO88834 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ShdO88834 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShdO88834 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShdO88834 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShdO88834 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShdO88834 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShdO88834 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShdO88834 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShdO88834 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShdO88834 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShdO88834 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ShdO88834 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShdO88834 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ShdO88834 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ShdO88834 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShdO88834 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShdO88834 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShdO88834 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShdO88834 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShdO88834 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShdO88834 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShdO88834 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShdO88834 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShdO88834 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ShdO88834 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShdO88834 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShdO88834 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShdO88834 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShdO88834 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ShdO88834 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ShdO88834 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShdO88834 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShdO88834 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShdO88834 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms