Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
BlmO88700 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BlmO88700 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BlmO88700 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BlmO88700 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BlmO88700 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
BlmO88700 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BlmO88700 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
BlmO88700 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BlmO88700 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BlmO88700 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
BlmO88700 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BlmO88700 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BlmO88700 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BlmO88700 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BlmO88700 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BlmO88700 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BlmO88700 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BlmO88700 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BlmO88700 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BlmO88700 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BlmO88700 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BlmO88700 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BlmO88700 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BlmO88700 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BlmO88700 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BlmO88700 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
BlmO88700 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
BlmO88700 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BlmO88700 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
BlmO88700 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
BlmO88700 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BlmO88700 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
BlmO88700 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
BlmO88700 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BlmO88700 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BlmO88700 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BlmO88700 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BlmO88700 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BlmO88700 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BlmO88700 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
BlmO88700 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
BlmO88700 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BlmO88700 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
BlmO88700 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BlmO88700 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
BlmO88700 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BlmO88700 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BlmO88700 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BlmO88700 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BlmO88700 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BlmO88700 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BlmO88700 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BlmO88700 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BlmO88700 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BlmO88700 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
BlmO88700 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BlmO88700 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BlmO88700 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
BlmO88700 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BlmO88700 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
BlmO88700 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BlmO88700 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BlmO88700 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
BlmO88700 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BlmO88700 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
BlmO88700 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BlmO88700 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BlmO88700 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BlmO88700 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BlmO88700 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BlmO88700 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BlmO88700 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
BlmO88700 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BlmO88700 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BlmO88700 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BlmO88700 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BlmO88700 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BlmO88700 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BlmO88700 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BlmO88700 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BlmO88700 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BlmO88700 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BlmO88700 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BlmO88700 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
BlmO88700 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BlmO88700 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
BlmO88700 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BlmO88700 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BlmO88700 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BlmO88700 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BlmO88700 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BlmO88700 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BlmO88700 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BlmO88700 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BlmO88700 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BlmO88700 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BlmO88700 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BlmO88700 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BlmO88700 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms