Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RradO88667 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RradO88667 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RradO88667 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RradO88667 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RradO88667 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RradO88667 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RradO88667 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RradO88667 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RradO88667 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RradO88667 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RradO88667 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RradO88667 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RradO88667 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RradO88667 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RradO88667 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RradO88667 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RradO88667 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RradO88667 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RradO88667 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RradO88667 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RradO88667 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RradO88667 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RradO88667 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RradO88667 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RradO88667 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RradO88667 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RradO88667 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RradO88667 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RradO88667 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RradO88667 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RradO88667 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RradO88667 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RradO88667 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RradO88667 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RradO88667 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RradO88667 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RradO88667 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RradO88667 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RradO88667 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RradO88667 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RradO88667 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RradO88667 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RradO88667 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RradO88667 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RradO88667 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RradO88667 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RradO88667 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RradO88667 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RradO88667 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RradO88667 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RradO88667 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RradO88667 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RradO88667 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RradO88667 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RradO88667 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RradO88667 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RradO88667 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RradO88667 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RradO88667 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RradO88667 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RradO88667 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RradO88667 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RradO88667 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RradO88667 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RradO88667 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RradO88667 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RradO88667 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RradO88667 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RradO88667 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RradO88667 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RradO88667 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RradO88667 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RradO88667 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RradO88667 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RradO88667 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RradO88667 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RradO88667 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RradO88667 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RradO88667 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RradO88667 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RradO88667 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RradO88667 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RradO88667 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RradO88667 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RradO88667 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RradO88667 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RradO88667 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RradO88667 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RradO88667 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RradO88667 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RradO88667 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RradO88667 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RradO88667 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.3 ms