Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Dync1i1O88485 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Dync1i1O88485 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Dync1i1O88485 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Dync1i1O88485 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Dync1i1O88485 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Dync1i1O88485 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,5 ms