Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnk4O88454 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk4O88454 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnk4O88454 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk4O88454 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnk4O88454 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms