Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klc1O88447 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klc1O88447 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc1O88447 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klc1O88447 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc1O88447 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klc1O88447 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc1O88447 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc1O88447 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc1O88447 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Klc1O88447 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klc1O88447 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms