Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tulp3O88413 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tulp3O88413 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tulp3O88413 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tulp3O88413 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp3O88413 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms