Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Vamp4O70480 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Vamp4O70480 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Vamp4O70480 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Vamp4O70480 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vamp4O70480 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Vamp4O70480 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vamp4O70480 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vamp4O70480 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vamp4O70480 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vamp4O70480 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vamp4O70480 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vamp4O70480 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Vamp4O70480 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms