Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lnx1O70263 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lnx1O70263 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lnx1O70263 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lnx1O70263 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lnx1O70263 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lnx1O70263 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lnx1O70263 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lnx1O70263 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lnx1O70263 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lnx1O70263 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lnx1O70263 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lnx1O70263 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lnx1O70263 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lnx1O70263 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lnx1O70263 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms