Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxq1O70220 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxq1O70220 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxq1O70220 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxq1O70220 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxq1O70220 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Foxq1O70220 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxq1O70220 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxq1O70220 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxq1O70220 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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