Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3aO70157 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3aO70157 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top3aO70157 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3aO70157 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top3aO70157 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3aO70157 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top3aO70157 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top3aO70157 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top3aO70157 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top3aO70157 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top3aO70157 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3aO70157 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top3aO70157 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top3aO70157 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top3aO70157 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top3aO70157 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms